More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3521 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  41.63 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  44.66 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  42.69 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  40.86 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  41.22 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  44.09 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  39.68 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  43.25 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  40.41 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  43.8 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  43.03 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  42.23 
 
 		 268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  42.46 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  40 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  45.23 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  42.46 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  42.46 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  43.58 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  38.89 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  40.94 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  42.63 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  43.14 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  40.16 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  42.69 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  42.75 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  40.16 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  38.85 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  42.04 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  39.18 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  40.41 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  38.62 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  40.98 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  39.76 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  40.57 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  41.39 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  38.78 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  38.62 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  37.3 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3570  two-component response regulator  39.37 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  45.28 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  39.5 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  41.28 
 
 		 461 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  39.17 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 		 474 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  36.61 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.19 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.84 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 953 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 157 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 		 336 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 636 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.94 
 
 		 701 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  37.61 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  37.27 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  36.67 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  32.74 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  31.78 
 
 		 109 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.93 
 
 		 704 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 989 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 		 701 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.7 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  35.25 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.27 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 989 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.79 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5854  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.19 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.23 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  35.4 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  30.63 
 
 		 657 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>