More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2302 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  39.32 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  39.32 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  38.05 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  40.2 
 
 		 268 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.26 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  37.17 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  38.61 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  38.98 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  37.17 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  38.24 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  37.19 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  34.43 
 
 		 265 aa  63.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  35.54 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  40.17 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  37.29 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  38.24 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  37.29 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  37.29 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  38.24 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4627  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.910799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  36.19 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  36.75 
 
 		 667 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  39.22 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  33.33 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  34.78 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  38.68 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  39 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  36.94 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  34.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.75 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  35.4 
 
 		 264 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  35.34 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  35.4 
 
 		 264 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  34.82 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  33.04 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  37.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.34 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.34 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.34 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.9 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  31.03 
 
 		 271 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.13 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  36 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  35.09 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  34.29 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 521 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  33.01 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  36.61 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 472 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 499 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  34.75 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.04 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.63 
 
 		 704 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  33.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 662 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  35.04 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 498 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  31.67 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  35 
 
 		 245 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.2 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 953 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.17 
 
 		 651 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  40 
 
 		 264 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.19 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  32.69 
 
 		 265 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5313  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.171465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  34.19 
 
 		 429 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.88 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.62 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  34.19 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  39.76 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  31.82 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 474 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  31.03 
 
 		 657 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 238 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  32.46 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  32.93 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.29 
 
 		 201 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  31.9 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  31.58 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3685  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 989 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>