More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6935 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  65.15 
 
 		 134 aa  178  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  47.24 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  42.06 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  45 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  44.17 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  44.17 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  44.74 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  43.86 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  39.32 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  37.8 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  38.46 
 
 		 271 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  39.64 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 602 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  42.86 
 
 		 264 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  43.53 
 
 		 264 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  32.17 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  39.13 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.11 
 
 		 471 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  43.53 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.73 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  33.93 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  37.5 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.04 
 
 		 849 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  41.67 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  41.67 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 		 651 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  30.47 
 
 		 265 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.97 
 
 		 635 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  37.07 
 
 		 264 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  35 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0694  response regulator  31.43 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  39.29 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  37.65 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.74 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  34 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  36.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  40.48 
 
 		 265 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  31.3 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  32.48 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  32.48 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.25 
 
 		 650 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  38.1 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  32.48 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  33.04 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  34 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  36.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  36.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  33.04 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  38.1 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.38 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  31.11 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  33.04 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 559 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 		 457 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.41 
 
 		 846 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  41.25 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.94 
 
 		 875 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  38.1 
 
 		 268 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1111 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  32.76 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  38.1 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  38.1 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  31.34 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 639 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  36.9 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  33.94 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  36.9 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  34.88 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  29.82 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35 
 
 		 844 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  28.81 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  34.88 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 855 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.75 
 
 		 582 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.65 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  34.88 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  36.05 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  29.17 
 
 		 1096 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  36.9 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  31.19 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2207  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.11 
 
 		 653 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 856 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>