More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2193 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  88.62 
 
 		 125 aa  219  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  42.98 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  42.11 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  45.22 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  41.74 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  41.24 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7005  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  36.13 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  37.72 
 
 		 264 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  39.25 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  38.26 
 
 		 273 aa  67  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  39.13 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  33.63 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  37.17 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  36.52 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  35.4 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  37.3 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  34.88 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  36.52 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  36.36 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  36.28 
 
 		 268 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  36.28 
 
 		 268 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  34.13 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  36.52 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  32.14 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  35.96 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  34.62 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  34.13 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  34.13 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  34.13 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  36.28 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  32.76 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  36.28 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  34.51 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  35.09 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  31.58 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  31.58 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  31.86 
 
 		 265 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  31.58 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  36.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  36.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  35.4 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  33.63 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  34.21 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  32.74 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  36.63 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  30.97 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  30.97 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  36.94 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  33.04 
 
 		 275 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  29.2 
 
 		 265 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  30.97 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.88 
 
 		 875 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 404 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1836  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.33 
 
 		 258 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5335  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.71 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2711  two component signal transduction response regulator  33.9 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  35.65 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  36.52 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 817 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.89 
 
 		 704 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 414 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  34.21 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  32.74 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  23.62 
 
 		 352 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  28.93 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 889 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  33.04 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  34.23 
 
 		 646 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 355 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  34.62 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  38.55 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>