95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2345 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  253  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  43.21 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  34.86 
 
 		 844 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  37.25 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  36.9 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1788  response regulator receiver domain-containing protein  37.86 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  39.02 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.36 
 
 		 844 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 602 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  29.29 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 556 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 639 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 567 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.59 
 
 		 852 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  32 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  32.71 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0706  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.381505 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  38.46 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  48.89 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1138 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.03 
 
 		 847 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 554 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 631 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 464 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  35.37 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  38.75 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  35.37 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 508 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  32.31 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 127 aa  42  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.23 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 133 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  30.08 
 
 		 264 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 234 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  34.51 
 
 		 234 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 303 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  37.61 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7005  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  30.69 
 
 		 264 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  30.43 
 
 		 264 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  29.73 
 
 		 575 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  35.37 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  29.57 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.36 
 
 		 849 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 734 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 		 855 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  31.31 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  35.4 
 
 		 594 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  38.46 
 
 		 847 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  32.5 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 856 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 127 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>