98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7005 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7005  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  246  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  40.19 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  39.02 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  37.3 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  44.71 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  43.53 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  45.12 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  33.04 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  32.74 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  33.63 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  33.33 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  33.93 
 
 		 264 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  32.14 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  31.15 
 
 		 267 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  31.25 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  31.25 
 
 		 264 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  31.15 
 
 		 267 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  31.31 
 
 		 263 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  35.35 
 
 		 264 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  30.36 
 
 		 264 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0694  response regulator  38.27 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  36.71 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  29.51 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 		 352 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  29.51 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  28.95 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  29.51 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  36.51 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  31.25 
 
 		 266 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  28.46 
 
 		 267 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 602 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  30.36 
 
 		 265 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  31.58 
 
 		 271 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  29.46 
 
 		 264 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  37.8 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  28.69 
 
 		 264 aa  47  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  42.68 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  42.68 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  30.7 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  27.68 
 
 		 265 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.87 
 
 		 426 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  28.46 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  28.57 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  28.46 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  28.46 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  34.15 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  28.46 
 
 		 254 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.27 
 
 		 651 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  33.33 
 
 		 249 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  28.68 
 
 		 268 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.36 
 
 		 236 aa  43.9  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  28.95 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  28.95 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  37.31 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  30.38 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 429 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.53 
 
 		 2468 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  32.1 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  28.95 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5824  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.91 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  27.05 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  27.87 
 
 		 268 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 129 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 240 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  41.82 
 
 		 130 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 130 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 129 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  29.63 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  27.71 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.53 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 483 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.65 
 
 		 701 aa  40.8  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  30.86 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 123 aa  40  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>