171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0272 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  83.59 
 
 		 127 aa  207  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  46.43 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  46.43 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.34 
 
 		 844 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.72 
 
 		 846 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  35.25 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 631 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  40.35 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  41.18 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.09 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.05 
 
 		 847 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  34.82 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.93 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 		 847 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.4 
 
 		 844 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  36.84 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.68 
 
 		 849 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  38.27 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  41.25 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3207  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.156524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  38.05 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 		 856 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  35 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.51 
 
 		 856 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  32.73 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  42.5 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.5 
 
 		 852 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  40.51 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  36.47 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 639 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  31.13 
 
 		 855 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  30.77 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 559 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  37.36 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  32.1 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  30.89 
 
 		 1096 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  35.14 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  31 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.77 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  32.73 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 346 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  41.46 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 602 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>