178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0677 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  100 
 
 		 104 aa  209  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  39 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  47.92 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  39.22 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 559 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  39.8 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  41.49 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  41.41 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  34.95 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  42.71 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 602 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.18 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 		 856 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.11 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  35.92 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  38.61 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  45.88 
 
 		 855 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  32.98 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.21 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  36.17 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  40.7 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  38.1 
 
 		 852 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  39.33 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  40.45 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  37.23 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  37 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 639 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.45 
 
 		 384 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.45 
 
 		 384 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.63 
 
 		 849 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  36.54 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  39.33 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  41.41 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.92 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  40 
 
 		 842 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  38 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  34 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  32.67 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.04 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.68 
 
 		 844 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  36 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.95 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  40.22 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  36.47 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  35.16 
 
 		 847 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  35.11 
 
 		 847 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 1111 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  34 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.01 
 
 		 846 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.31 
 
 		 481 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  40.62 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.61 
 
 		 635 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  31.37 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.65 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  36.26 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  32.22 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  35.35 
 
 		 1096 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1096 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>