More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1629 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  51.16 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  40.68 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  40.71 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  39.09 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 631 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.34 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.29 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  37.84 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.13 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.87 
 
 		 471 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.51 
 
 		 461 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  43.04 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  35.78 
 
 		 852 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  36.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30 
 
 		 844 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 		 651 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 639 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  34.62 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 337 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.53 
 
 		 457 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.31 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  39.09 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  39.56 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  35.09 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.9 
 
 		 846 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 559 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  38.14 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  34.21 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  33.64 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  34.38 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  34.21 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  34.74 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.04 
 
 		 849 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  41.76 
 
 		 875 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.74 
 
 		 635 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.74 
 
 		 457 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.73 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.73 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  35.59 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  34.21 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  35.09 
 
 		 268 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  38.46 
 
 		 657 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  35.09 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  34.21 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.94 
 
 		 847 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.62 
 
 		 842 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.02 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 571 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  29.92 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>