More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2520 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  80.17 
 
 		 123 aa  203  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  82.11 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  79.51 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  73.98 
 
 		 131 aa  190  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  72 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  66.4 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  42.98 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  46.23 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  51.02 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  39.45 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  41.41 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  36.04 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 602 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 639 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  38.14 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.1 
 
 		 384 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  39.13 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.39 
 
 		 846 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 855 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 631 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  35.85 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  37.96 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.61 
 
 		 852 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 559 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  35.2 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 		 856 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.82 
 
 		 842 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  37.37 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5321  putative sensory transduction regulatory protein  44.74 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563131  normal  0.70291 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.38 
 
 		 849 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  35.45 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.38 
 
 		 847 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  35.92 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  37.5 
 
 		 856 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.68 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  33.61 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.82 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  34.91 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.96 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.96 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.96 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.79 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.26 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 927 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  36.75 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  36.73 
 
 		 847 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.96 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.96 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  33.33 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 691 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.26 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  33.33 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>