129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3234 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  32.14 
 
 		 149 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  37.96 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  39.17 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 122 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  41.49 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 123 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  33.61 
 
 		 1096 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  30.83 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  34.71 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  33.98 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 120 aa  62  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 159 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.66 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 792 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1111 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  33.61 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 127 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.75 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  31.58 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  32.76 
 
 		 125 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.17 
 
 		 846 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  31.13 
 
 		 124 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 123 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1096 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  38.37 
 
 		 127 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  32.95 
 
 		 107 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  33.33 
 
 		 104 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 129 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 133 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3207  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 117 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.156524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  27.15 
 
 		 151 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 127 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 123 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 125 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 132 aa  51.6  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 121 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  27.73 
 
 		 126 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  28.95 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  28.81 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  27.59 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 121 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 119 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  28.18 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  30.69 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.11 
 
 		 651 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.46 
 
 		 852 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 129 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30 
 
 		 129 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 639 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 631 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  28.32 
 
 		 842 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.03 
 
 		 849 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  28.43 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  28.71 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>