223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2091 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  99.24 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  42.74 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  52.48 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  36.36 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.52 
 
 		 849 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.74 
 
 		 846 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 602 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.76 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 631 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  34.38 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  29.31 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  31.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.11 
 
 		 852 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 207 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 408 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  30.56 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 650 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.03 
 
 		 844 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.33 
 
 		 842 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  29.2 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  29.57 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  30.36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.17 
 
 		 856 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  38.75 
 
 		 844 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.25 
 
 		 875 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  33.67 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  31.82 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  29.91 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 384 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  29.36 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  32.41 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 227 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 		 651 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  32.17 
 
 		 657 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 635 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  28.57 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  29.17 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  29.06 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  30.61 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  29.91 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 243 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  32 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 639 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1111 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 		 461 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 817 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 589 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.82 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.32 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 559 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>