More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0708 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  44.83 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  45.87 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  41.18 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 114 aa  95.9  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  40.5 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  41.82 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  38.84 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.44 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 602 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  39.47 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.86 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  37.39 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  43.12 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 559 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  37.61 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  43.27 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  39.81 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  40.57 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  37.96 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  36.45 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.89 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  40.66 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  38.64 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 631 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 207 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  35.92 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.78 
 
 		 846 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  39.53 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.51 
 
 		 847 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  32.38 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  33.63 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  38.24 
 
 		 847 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 639 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.48 
 
 		 847 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 		 855 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.29 
 
 		 844 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 856 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.65 
 
 		 1096 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  36.52 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  34.55 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  37.21 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.48 
 
 		 849 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1111 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.17 
 
 		 842 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>