181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3106 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  39.39 
 
 		 852 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  40.52 
 
 		 855 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.02 
 
 		 846 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.96 
 
 		 847 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.88 
 
 		 847 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  35.88 
 
 		 856 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  41.23 
 
 		 856 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 847 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  34.68 
 
 		 844 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.98 
 
 		 849 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 639 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  36.13 
 
 		 842 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.45 
 
 		 844 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  35.9 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  35.77 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  32.79 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  35.83 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  37.29 
 
 		 1096 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.48 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  32.5 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  33.87 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  38.74 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 837 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 1111 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.8 
 
 		 1036 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 783 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 559 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 589 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 589 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 611 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  39.06 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 588 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 814 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1076 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  33.33 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  32.5 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  35.11 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  42.19 
 
 		 107 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1096 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.83 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 691 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 384 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 384 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1164 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  30.17 
 
 		 1164 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>