103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5755 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  31.13 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  37.36 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  37.36 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  37.36 
 
 		 264 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  39.74 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  34 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  36 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  32.73 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  39.47 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  36.96 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  36.96 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  37 
 
 		 264 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 		 414 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  36.96 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  32.67 
 
 		 264 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  31.36 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  31.82 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  36.17 
 
 		 264 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  31 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  35 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  35 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  35.51 
 
 		 267 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  31 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  36.63 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  36.63 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  35.16 
 
 		 264 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  36.63 
 
 		 267 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 340 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  33.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  32 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  31 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  30.56 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  33 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  33.7 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  31.52 
 
 		 235 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  32 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  32.97 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.11 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  35.48 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  30 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.88 
 
 		 788 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  33.33 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  27.93 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  27.93 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  30 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  30 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  33.64 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  33.64 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  28.7 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  29.75 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  34.07 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 688 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 699 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  32.61 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  27.56 
 
 		 875 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  34.45 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  30.56 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  37.01 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2810  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 299 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 703 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  37.01 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3294  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  28.33 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0118223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1472  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  30.28 
 
 		 275 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  27.42 
 
 		 917 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  37.29 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  32.74 
 
 		 249 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 558 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 822 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 639 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  31.18 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  25.76 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0873  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 135 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>