99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4738 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  296  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  47.69 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  46.92 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  40.87 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  39.53 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  39.72 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  43.28 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  40.87 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  39.34 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  44.44 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  44.44 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7005  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  40 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  42.28 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  33.83 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  31.3 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  37.5 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  38.37 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  31.3 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  38.37 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  35.63 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  32.18 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  37.5 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  33.33 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  37.21 
 
 		 267 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  38.37 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  30.77 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  35.23 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  30.43 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  33.33 
 
 		 264 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  32.18 
 
 		 264 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  36.59 
 
 		 274 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  31.03 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  29.57 
 
 		 264 aa  50.4  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  36.47 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.82 
 
 		 856 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  36.47 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  29.55 
 
 		 264 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.12 
 
 		 651 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  35.37 
 
 		 268 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  33.72 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  32.56 
 
 		 254 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  35.37 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  31.82 
 
 		 264 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  33.88 
 
 		 844 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  35.37 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  32.56 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  32.1 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  32.56 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  32.53 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  36.36 
 
 		 271 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  32.32 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  32.32 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1788  response regulator receiver domain-containing protein  37.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  26.45 
 
 		 875 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.56 
 
 		 635 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.93 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.93 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.24 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 250 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 859 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  27.91 
 
 		 264 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.5 
 
 		 457 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1643  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2229  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  33 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.83 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  26.72 
 
 		 657 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  30.49 
 
 		 249 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 414 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 238 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 853 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  35 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  30 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  28.95 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  34.52 
 
 		 847 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>