More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1059 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  291  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2711  two component signal transduction response regulator  33.05 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.78 
 
 		 704 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 591 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 429 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 702 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  35.09 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 248 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  27.87 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.93 
 
 		 455 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 602 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.93 
 
 		 455 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  32 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  26.47 
 
 		 336 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 337 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1055 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 373 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 226 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 249 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 236 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  29.89 
 
 		 352 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 905 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 636 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 762 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 340 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  36.75 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.9 
 
 		 457 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 457 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 		 844 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  32.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  32.52 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1021 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.5 
 
 		 651 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 641 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  33.04 
 
 		 1092 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 712 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 		 257 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1103 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 922 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 999 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 556 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  28.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  32.76 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.61 
 
 		 1036 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 989 aa  47.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 689 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 457 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.71 
 
 		 481 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  30.08 
 
 		 695 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 695 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 957 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 236 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 244 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  34.58 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 953 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  33.62 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 352 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.26 
 
 		 461 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 603 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 662 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.52 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  30.99 
 
 		 235 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 571 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.07 
 
 		 239 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  29.84 
 
 		 537 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 316 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 456 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1917 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  32.77 
 
 		 1164 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>