More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5569 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  40 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  36.45 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  33.61 
 
 		 852 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.82 
 
 		 651 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  32.18 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.62 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.17 
 
 		 847 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.18 
 
 		 846 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 855 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  34.4 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.48 
 
 		 704 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  32.97 
 
 		 847 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.25 
 
 		 844 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 953 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.77 
 
 		 847 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 856 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 602 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  30.28 
 
 		 376 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  32 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.29 
 
 		 849 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.96 
 
 		 239 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  35.24 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 233 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  35.37 
 
 		 844 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1111 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 		 384 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  26.55 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  29.81 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  35 
 
 		 1096 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 837 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  28.57 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  28.57 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  31.76 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  28.57 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.31 
 
 		 856 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  30.91 
 
 		 657 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  32.26 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 		 461 aa  48.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  35.9 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  31.5 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.68 
 
 		 461 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  25.66 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 559 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  33.03 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  28.83 
 
 		 265 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  38.81 
 
 		 267 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 		 471 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 343 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  32.2 
 
 		 265 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  33.77 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.72 
 
 		 875 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 813 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  28.95 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.78 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  27.68 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2711  two component signal transduction response regulator  27.73 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5546  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  hitchhiker  0.0000418049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  29.13 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  27.93 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  33.33 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2002  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 473 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 589 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  30.63 
 
 		 267 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  30.48 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  26.27 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  26.79 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>