118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7958 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  78.23 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.54 
 
 		 384 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.54 
 
 		 384 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  39.64 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.77 
 
 		 846 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  38.38 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  39.81 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  37.23 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.04 
 
 		 847 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  36.21 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.14 
 
 		 847 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.53 
 
 		 852 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1111 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 602 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  31.97 
 
 		 1096 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.63 
 
 		 844 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 559 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.14 
 
 		 847 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  29.57 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32.99 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  30.93 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  30.93 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  31.78 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  27.68 
 
 		 844 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  30.84 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1096 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  33 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  32 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  30 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  32.2 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  31 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  33.67 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  29.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  32.14 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  34.15 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 639 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  32.14 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  32.47 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  31.19 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.83 
 
 		 856 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  34.62 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  31.46 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  31.76 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  31 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.57 
 
 		 849 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  29.41 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2207  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33 
 
 		 653 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>