86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6170 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  66.09 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  60.48 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  63.3 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  46.75 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.63 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.63 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  37.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  31.58 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  35.05 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  36.08 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  30.91 
 
 		 852 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  38.46 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1111 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.44 
 
 		 1096 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.77 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  36.36 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  33 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  39.74 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.7 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  34.18 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.09 
 
 		 844 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 602 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  27.68 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  28.04 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1096 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.1 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  30.11 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  37.31 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 792 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  24.14 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25 
 
 		 846 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  25 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  32.94 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  26.17 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  31.07 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 559 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  32.91 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  27.37 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  30 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 639 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 119 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>