More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4846 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  55.46 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  47.9 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  49.11 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  51.19 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  52.75 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  43.8 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  40.17 
 
 		 856 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  46.99 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  35.65 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 1111 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 631 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 		 855 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.98 
 
 		 846 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  45.88 
 
 		 1096 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.79 
 
 		 847 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.74 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.88 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  36.61 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 639 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  39.66 
 
 		 847 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  40.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  40.71 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  36.61 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  35.25 
 
 		 856 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  37.93 
 
 		 847 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.89 
 
 		 844 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  44.58 
 
 		 844 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  44.68 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  39.17 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.68 
 
 		 849 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  38.32 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 1096 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  36.21 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  42.17 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  48.19 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  46.99 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  41.11 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  35.64 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.19 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  42.22 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  33.93 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  36 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  39.42 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  33.04 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.9 
 
 		 704 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  35.19 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>