More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3207 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3207  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  225  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.156524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.21 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.52 
 
 		 240 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2785  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  27.5 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.66 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  37.84 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 647 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 233 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  35.14 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.64 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.47 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1649  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 842 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0393  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.632289  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.84 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0259  two component signal transduction response regulator  28.21 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  39.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  39.32 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  33.93 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  34.92 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  39.5 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 652 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 689 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.48 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.14 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.74 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.74 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>