67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4303 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  43.9 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  39.74 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  38.2 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  32.5 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  39.51 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.33 
 
 		 384 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  39.51 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  37.5 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  35.9 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  35.96 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  33.02 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  29.2 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 639 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5566  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118184  normal  0.0168519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1111 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  32.91 
 
 		 1096 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.75 
 
 		 471 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 559 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.78 
 
 		 651 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36 
 
 		 846 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.58 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  37.66 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  40.3 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  36.11 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1649  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.831857  normal  0.0382738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.75 
 
 		 461 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 1096 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>