291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3685 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3685  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5313  response regulator receiver protein  61.22 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.171465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4627  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.910799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  38.39 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  33.93 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 953 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  33.04 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  34.82 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  34.82 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 571 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  31.25 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  34.82 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 429 aa  57  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.95 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  31.62 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  31.25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  31.25 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  30.36 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  31.25 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  36.27 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  27.68 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  30.51 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  32.14 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  33.04 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  35.29 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  31.25 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  30.36 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  33.04 
 
 		 267 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  31.25 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  33.04 
 
 		 267 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.58 
 
 		 844 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  40.24 
 
 		 429 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  32.14 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  31.25 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  31.25 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  34.65 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 343 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0694  response regulator  37.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 		 336 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  34.88 
 
 		 274 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 461 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  32.18 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  28.57 
 
 		 264 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  35.23 
 
 		 235 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  36.61 
 
 		 249 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  37.61 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  30.36 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 337 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  31.86 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 376 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  30.36 
 
 		 264 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.58 
 
 		 432 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.64 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  36.27 
 
 		 257 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  30.77 
 
 		 264 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  31.86 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  31.86 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  31.86 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  29.84 
 
 		 609 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.14 
 
 		 457 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  31.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 472 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.29 
 
 		 849 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  29.46 
 
 		 264 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  28.33 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  30.36 
 
 		 263 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2193  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.37 
 
 		 351 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2226  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 		 569 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.977744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  28.06 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 386 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.65 
 
 		 426 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 229 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 531 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  34.83 
 
 		 404 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  35.96 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 425 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 639 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1630  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 410 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34 
 
 		 846 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.53 
 
 		 701 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 589 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.82 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  32 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 240 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  30.36 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.07 
 
 		 651 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>