More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2383 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2383  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
800 aa  1605    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565454  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1284 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1767 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.02 
 
 
1331 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
1390 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.73 
 
 
2213 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
721 aa  250  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.59 
 
 
932 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1767 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.59 
 
 
1014 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1266 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1303 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  33.59 
 
 
932 aa  247  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1333 aa  246  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
921 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  33.27 
 
 
1439 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.67 
 
 
933 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.96 
 
 
1499 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
912 aa  240  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
649 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.64 
 
 
1214 aa  240  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1771 aa  240  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.32 
 
 
929 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.07 
 
 
933 aa  239  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
927 aa  239  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  32.15 
 
 
918 aa  238  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  32.15 
 
 
918 aa  238  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
909 aa  238  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 
918 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1005 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
757 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.27 
 
 
1135 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.68 
 
 
918 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
636 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1193 aa  234  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  33.45 
 
 
914 aa  234  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1124 aa  233  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.54 
 
 
941 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.53 
 
 
933 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.53 
 
 
933 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.53 
 
 
932 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.53 
 
 
933 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  32.56 
 
 
918 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
914 aa  231  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
964 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
752 aa  231  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  29.22 
 
 
727 aa  230  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
682 aa  230  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
778 aa  230  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
737 aa  230  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.29 
 
 
935 aa  230  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.24 
 
 
935 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
782 aa  230  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
720 aa  230  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
1131 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  32.43 
 
 
931 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  33.21 
 
 
918 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.15 
 
 
917 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  35.16 
 
 
1118 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  34.36 
 
 
896 aa  228  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.97 
 
 
935 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.51 
 
 
921 aa  228  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1042 aa  228  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  31.36 
 
 
917 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1141 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.58 
 
 
923 aa  227  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
770 aa  227  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.52 
 
 
858 aa  227  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.89 
 
 
935 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  31.81 
 
 
905 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1316 aa  226  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.64 
 
 
1442 aa  225  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.5 
 
 
937 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  31 
 
 
650 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
745 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  33.28 
 
 
699 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1033 aa  224  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.27 
 
 
1407 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  31.93 
 
 
962 aa  223  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
758 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1788 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  30.43 
 
 
977 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.74 
 
 
937 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
929 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1016 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  33.4 
 
 
1119 aa  222  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  33.79 
 
 
1064 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
948 aa  220  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
916 aa  220  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
919 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  30.44 
 
 
765 aa  220  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.71 
 
 
925 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
956 aa  220  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>