153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6516 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 256 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  63.56 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  62.35 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  62.35 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  51.22 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  42.11 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  41.94 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  49.59 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  40.32 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  41.63 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  41.59 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  38.96 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  42.19 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  37.13 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  34.89 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  36.71 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  31.03 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  26.51 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.13 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  30.62 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  27.76 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  26.51 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  29.11 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  29.36 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  28.93 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  28.98 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  29.96 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  28.28 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  25.88 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  27.89 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  28.86 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  29.39 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  24.29 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.99 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  25.89 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  26.99 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  24.4 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  23.17 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  27.16 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  25.78 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.89 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.19 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  27.4 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.19 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  22.58 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  27.93 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  26.22 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  25.45 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  23.96 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  27.16 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  25.46 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  25.94 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  24.55 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.42 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  22.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  28.11 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  23.08 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  26.21 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  28.44 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  28.29 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  22.62 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  23.83 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  23.83 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  26.79 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  25.22 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.79 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  25.42 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  23.91 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  23.43 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  22.08 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  22.07 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  23.15 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>