175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0378 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  95.6 
 
 		 250 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  56.4 
 
 		 250 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  55.02 
 
 		 250 aa  294  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  41.28 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  42.31 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  38.03 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  35.56 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  39.13 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  37.77 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  37.77 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  37.13 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  38.2 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  37.85 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  30.47 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  25.69 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  27.02 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 		 254 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  26.1 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  25.81 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.18 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  25.42 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.21 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  28.03 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  31.46 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  28.77 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  28.77 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.39 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.47 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  23.08 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  26.01 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  26.16 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  24.12 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.55 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  27.16 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  21.6 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  21.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  24.46 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  30.24 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.89 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  22.92 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  20.85 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  27.97 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  22.98 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.46 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  21.7 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  25.73 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.77 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  23.01 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  23.87 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  23.87 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  23.87 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  23.87 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  22.22 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  23.42 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  23.01 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  25.62 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  25.53 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  23.51 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  23.01 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  22.47 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  25.73 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  22.59 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.73 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  23.79 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.52 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  25.82 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  22.03 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  25.1 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.82 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.52 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  23.29 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  22.92 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  23.85 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>