221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1119 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  46.53 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  50.42 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  46.03 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  46.03 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  45.19 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  47.08 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  47.72 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  39.75 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  38.91 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  40.32 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  37.85 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  40.89 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  35.6 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  38.32 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  33.94 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30.7 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.77 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.64 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  30.58 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  33.49 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  37.67 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  37.44 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  36.77 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  28.17 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  29.17 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  33.02 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.6 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  32.7 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32.7 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  30.18 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  26.61 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  29.26 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.4 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  28.84 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.64 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.3 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  25.79 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  26.22 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.73 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.02 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.45 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  29.77 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  25.22 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  24.55 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  29.58 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  23.19 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  26.2 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  23.75 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  26.2 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  28.5 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.52 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  26.94 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  24.11 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  26.89 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  26.46 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  26.23 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  25.81 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.22 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  27.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  27.1 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  24.79 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  27.19 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  23.91 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  24.23 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  26.1 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.57 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  22.81 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.15 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  28.77 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  28.04 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  28.32 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  24.07 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>