297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1640 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
253 aa  487  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  35.51 
 
 
261 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  34.58 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  34.11 
 
 
261 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  35.05 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  32.72 
 
 
260 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 
257 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.78 
 
 
255 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  33.81 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  32.2 
 
 
264 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  31.11 
 
 
254 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  36.68 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  35.65 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
261 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  31.9 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  33.03 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
265 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  30.18 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  30.84 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  31.8 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  35.62 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  32.11 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  35.41 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  35.51 
 
 
256 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  31.65 
 
 
255 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  28.26 
 
 
264 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  32.27 
 
 
255 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 
257 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  32.72 
 
 
253 aa  109  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.28 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 
264 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 
264 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
253 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  33.8 
 
 
263 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
264 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 
263 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
262 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.88 
 
 
261 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 
260 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.08 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
256 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  30.45 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 
261 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 
266 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  35.1 
 
 
239 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  30.81 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  30.59 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 
260 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  28.76 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  30.14 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.76 
 
 
258 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  29.6 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  30.19 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  32.88 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  30.24 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  28.76 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  26.81 
 
 
267 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>