More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3906 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  96.17 
 
 		 261 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  62.07 
 
 		 261 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  50.76 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  52.16 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  50 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  50 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  36.82 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  34.29 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.45 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  32 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  35.44 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  36.61 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.59 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  34.11 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  32.48 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  32.48 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.22 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31.44 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  34.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.46 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.4 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.77 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  28.97 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.09 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.91 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.94 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  30.29 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  35.04 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.73 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.73 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30.51 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  32.23 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  32.92 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  30.86 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  33.81 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  30.14 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  29.83 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.61 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  27.85 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  29.96 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  27.82 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  25.41 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  28.93 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  27.24 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>