More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4136 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  36.29 
 
 
259 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  37.08 
 
 
264 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  34.27 
 
 
260 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  35.14 
 
 
265 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
265 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  35.34 
 
 
264 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  38.56 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  35.74 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 
255 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  37.85 
 
 
253 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  31.74 
 
 
261 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.73 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  34.74 
 
 
266 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  34.7 
 
 
255 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  35.04 
 
 
259 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 
265 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 
253 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  34.75 
 
 
257 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  31.72 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  35.94 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  31.71 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 
255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  34.33 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  33.49 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  32.38 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  27.95 
 
 
260 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  34.56 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  32.53 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
250 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
260 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  32.43 
 
 
261 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  33.77 
 
 
255 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 
255 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 
255 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 
256 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
254 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 
255 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 
256 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 
252 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 
260 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  31.72 
 
 
253 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 
257 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.17 
 
 
261 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 
261 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  25.87 
 
 
258 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  33.5 
 
 
255 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  36.24 
 
 
256 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  29.61 
 
 
252 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  28.95 
 
 
256 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  29.92 
 
 
258 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  31 
 
 
258 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  30.7 
 
 
266 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 
251 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 
264 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  30.7 
 
 
264 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
267 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  32.41 
 
 
265 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 
263 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  32.41 
 
 
265 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  32.41 
 
 
265 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 
253 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.69 
 
 
265 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  31.94 
 
 
265 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  30.12 
 
 
258 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  29.1 
 
 
253 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  32.51 
 
 
255 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  29.55 
 
 
254 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.38 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  30.5 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30.29 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30.29 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30.29 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
253 aa  99  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  32.71 
 
 
259 aa  99  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  32.44 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  32.44 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  29.72 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.94 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.39 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  29.02 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>