210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2980 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 260 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  99.23 
 
 		 260 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  74.1 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  48.05 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  43.78 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  47.56 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  36.73 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  36.86 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  35.4 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  37.02 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  35.81 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  34.07 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  33.76 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  34.87 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  38.27 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  37.38 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  37.17 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  35.84 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  38.43 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  31.88 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  29.76 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.05 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  38.02 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  36.89 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  29.75 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  32.17 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  31.67 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  34.39 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.88 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.73 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  32.52 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  27.82 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.95 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.7 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  27.89 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  34.36 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  34.36 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.74 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  28.06 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  26.7 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  27.8 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.59 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  26.5 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  27.35 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.42 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.17 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.01 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.28 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  27.91 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  25.7 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.98 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.72 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.57 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  26.21 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.38 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.53 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.53 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  31.53 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  27.8 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.77 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.58 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  27.9 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.47 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  25.98 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.48 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  25.46 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  29.9 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  27.73 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>