207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4187 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 256 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  47.62 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  48.05 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  48.05 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  48.95 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  49.52 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  33.75 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  33.74 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  32.77 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  34.98 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  33.91 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  32.48 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  33.63 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  34.95 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  34.95 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  33.18 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  32.26 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  32.26 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  34.91 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  33.07 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.03 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  35.27 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  32.03 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  31.94 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  32.68 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  34.06 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  32.5 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  30.28 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  29.22 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  32.34 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  34.12 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  31.15 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.05 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  30.15 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  27.47 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  28.99 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  29.54 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  26.16 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  29.54 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  27.59 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  29.54 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  27.24 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  27.73 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  27.64 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  32.88 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  28.9 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  26.4 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  30.24 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  31.56 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  29.46 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  24.9 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.38 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  25.31 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  29.55 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.55 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.55 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  29.24 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.32 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  28.03 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  25.22 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  23.94 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  27.64 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  26.79 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.52 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.33 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  30.14 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  30.22 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  26.73 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.44 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  27.51 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.32 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>