287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1514 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  53.52 
 
 
259 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  51.76 
 
 
259 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  48.66 
 
 
265 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  48.66 
 
 
265 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  48.66 
 
 
265 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  49.04 
 
 
265 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  47.81 
 
 
267 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  47.51 
 
 
265 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  45.38 
 
 
265 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  46.74 
 
 
265 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  46.74 
 
 
265 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  46.74 
 
 
265 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  46.36 
 
 
265 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  45.38 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  46.96 
 
 
265 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  44.92 
 
 
266 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  43.19 
 
 
260 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  44.83 
 
 
260 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  43.68 
 
 
260 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  45.34 
 
 
261 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  45.68 
 
 
262 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  44.44 
 
 
260 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  43.15 
 
 
261 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  42.17 
 
 
261 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  42.64 
 
 
258 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  40.31 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  42.25 
 
 
258 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  40.55 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  41.77 
 
 
258 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  39.37 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  37.6 
 
 
261 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  40.17 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.29 
 
 
260 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  40.44 
 
 
257 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  38.13 
 
 
262 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  37.82 
 
 
260 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 
263 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  39.72 
 
 
236 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  38.32 
 
 
247 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 
260 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  36.28 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  38.07 
 
 
260 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  34.55 
 
 
258 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 
258 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.55 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.1 
 
 
256 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.1 
 
 
256 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  38.67 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  42.11 
 
 
258 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  33.61 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  39.21 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  37.34 
 
 
257 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  37.66 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  39.52 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  38.5 
 
 
247 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.69 
 
 
265 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 
259 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  40.09 
 
 
261 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  38.53 
 
 
266 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
260 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  36.76 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  44.86 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  35.34 
 
 
256 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  34.05 
 
 
240 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  34.36 
 
 
256 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.27 
 
 
261 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  36.36 
 
 
253 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  40.09 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  39.62 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  39.62 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  39.62 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  39.62 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  37.11 
 
 
259 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  33.33 
 
 
269 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
269 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
260 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  29.67 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 
260 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  37.55 
 
 
261 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>