282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2231 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
253 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  71.31 
 
 
254 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  71.26 
 
 
258 aa  331  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  69.17 
 
 
252 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  71.26 
 
 
258 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  71.65 
 
 
258 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  46.19 
 
 
255 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  45 
 
 
256 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  47.48 
 
 
256 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  42.97 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  44.17 
 
 
255 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  45.38 
 
 
255 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  43.65 
 
 
253 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  45.38 
 
 
256 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  40.89 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  41.55 
 
 
251 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  33.65 
 
 
248 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  34.54 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  29.67 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  30.26 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
256 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.69 
 
 
250 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 
250 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  34.87 
 
 
260 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  34.87 
 
 
260 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  26.29 
 
 
250 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  32.26 
 
 
259 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
259 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  29.41 
 
 
249 aa  101  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  27.5 
 
 
259 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  31.4 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 
260 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 
248 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  30.4 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  30.73 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.72 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.56 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  29.29 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  31.96 
 
 
256 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.96 
 
 
256 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.75 
 
 
260 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  32 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  31.56 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  28.23 
 
 
255 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  26.97 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.71 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  33.53 
 
 
264 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 
247 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  29.78 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  25.63 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  26.25 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  25.54 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  29.57 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  29.53 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  27.67 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  24 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  27.13 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  26.23 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  28.15 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  30.24 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  27.98 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 
263 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  29.79 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  29.06 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  28.14 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  30.94 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.85 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.74 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  29.26 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>