283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3216 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  96.98 
 
 
265 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  96.6 
 
 
265 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  96.21 
 
 
265 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  94.34 
 
 
265 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  91.32 
 
 
265 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  91.32 
 
 
265 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  91.32 
 
 
265 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  90.94 
 
 
265 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  78.33 
 
 
265 aa  427  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  75.29 
 
 
267 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  74.81 
 
 
267 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  78.41 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  73.28 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 
266 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  76.06 
 
 
261 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  52.31 
 
 
260 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  53.85 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  51.15 
 
 
260 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  49.04 
 
 
260 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  51.92 
 
 
260 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  48.64 
 
 
259 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  48 
 
 
259 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  46.89 
 
 
261 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  45.9 
 
 
258 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  45.45 
 
 
261 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  48.15 
 
 
261 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  44.92 
 
 
258 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  44.94 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  44.44 
 
 
258 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  47.83 
 
 
258 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  47.83 
 
 
258 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.39 
 
 
261 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  44.77 
 
 
258 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  42.28 
 
 
257 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  44.35 
 
 
258 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  44 
 
 
253 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  45.3 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  43.05 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  43.32 
 
 
247 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 
260 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  41.92 
 
 
260 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  37.4 
 
 
263 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  45.54 
 
 
236 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  38.14 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  41.2 
 
 
265 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 
260 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  41.43 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  38.8 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.6 
 
 
256 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.6 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  39.73 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  39.3 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  36.21 
 
 
259 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  36.8 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  36.64 
 
 
259 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  41.38 
 
 
260 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  40.95 
 
 
260 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  39.27 
 
 
259 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
260 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  42.45 
 
 
266 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  36.48 
 
 
260 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  41.74 
 
 
260 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  34.05 
 
 
259 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  37.55 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  40.83 
 
 
260 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  36.89 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  39.39 
 
 
260 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  39.39 
 
 
260 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  37.12 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  40.25 
 
 
264 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 
257 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  39.83 
 
 
264 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  39.83 
 
 
264 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  39.83 
 
 
264 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  39.42 
 
 
264 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  39.3 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  35.56 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  39.3 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  38.52 
 
 
261 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  34.5 
 
 
261 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  39.3 
 
 
261 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  38.91 
 
 
261 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  39.92 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  36.28 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
247 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  39.92 
 
 
261 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  39.92 
 
 
261 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>