290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5151 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  89.33 
 
 		 254 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  69.17 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  66.54 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  66.14 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  66.14 
 
 		 258 aa  284  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  47.28 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  45.56 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  46.84 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  44.49 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  44.77 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  46.34 
 
 		 255 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  46.84 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  41.63 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  41.35 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  39.83 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  35.27 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.79 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  35.74 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  38.65 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.65 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  29.41 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  35.29 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  33.61 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.51 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.09 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.33 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  25.61 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.44 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.67 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.85 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.62 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  29.24 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  32.81 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.47 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  29.26 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  27.08 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.86 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  33.94 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  29.79 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  36.07 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  29.73 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  28.22 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.33 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  26.69 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  32.53 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  33.93 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  28.19 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.41 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  29.05 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  29.65 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  27.54 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  29.8 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  26.43 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.29 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  31.8 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.8 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  31.54 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  30.58 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  23.21 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  26.99 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  26.48 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  27.08 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  35.62 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.02 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  23.65 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  27.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.02 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.61 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.82 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>