285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2634 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 258 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  92.64 
 
 		 258 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  93.8 
 
 		 258 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  71.65 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  67.72 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  66.14 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  48.55 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  48.1 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  48.95 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  46.89 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  44.81 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  43.87 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  46.86 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  46.69 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  42.39 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  40.95 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  36.6 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  35.25 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  40.54 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  37.26 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  37.86 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  37.86 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  27.42 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  27.02 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.05 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.86 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.39 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  32.92 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  31.73 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.3 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  27.67 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.33 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  31.43 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  26.25 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.74 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.67 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.41 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.74 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  34.02 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.8 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  29.2 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  32.35 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.3 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  31.86 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  31.86 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.45 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  30.97 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  29.83 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  31.43 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  36.49 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  34.1 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  28.69 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.14 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  28.97 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.05 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  28.24 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.2 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  30.09 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  29.67 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  31.08 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  31.38 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  28.84 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.74 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.24 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  28.4 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.33 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  26.11 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  32.27 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>