289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0010 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  32.71 
 
 
257 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.75 
 
 
259 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 
265 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  29.65 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30.26 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.58 
 
 
265 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
258 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
264 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  32.81 
 
 
259 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  32.4 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  33.17 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  32.37 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 
258 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  29.53 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.62 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.17 
 
 
261 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  30.48 
 
 
253 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.76 
 
 
260 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  26.41 
 
 
261 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.47 
 
 
260 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.64 
 
 
264 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.92 
 
 
266 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.39 
 
 
261 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 
253 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.97 
 
 
261 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  32.53 
 
 
258 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
258 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 
258 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  36.36 
 
 
253 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 
252 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 
262 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.81 
 
 
261 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  29.41 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  33.49 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  29.88 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.62 
 
 
261 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  28.74 
 
 
264 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.6 
 
 
259 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  31.65 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.75 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  27.6 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  30.56 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  27.6 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.15 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  33.17 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  32.39 
 
 
258 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 
260 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 
250 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  33.65 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  31.38 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  29.31 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.58 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  28.44 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  29.61 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  28.09 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  29.61 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  27.93 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.03 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  27.52 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  27.52 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.78 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  30.84 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.73 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  29.06 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  31.6 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.52 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  26.47 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  31.6 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>