192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0346 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 250 aa  493  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  95.6 
 
 		 250 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  54.8 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  53.41 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  42.13 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  40.85 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  42.31 
 
 		 239 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  37.61 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  35.98 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  39.13 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  37.6 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  38.43 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  37.6 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  36.71 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  38.3 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  33.17 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  28.39 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  30.47 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  31.7 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  25.64 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  25.61 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  25.23 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  27.42 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  29.09 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  27.9 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  25.81 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  31.38 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.26 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.91 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  29.6 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  25.82 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  27.62 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  31.82 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.53 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  28.3 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  28.3 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  25.62 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  22.31 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  26.46 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  26.58 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  23.08 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  27.16 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  22.13 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  26.36 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  23.33 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.32 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  23.87 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  24.67 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  21.28 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.12 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  24.88 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  25.43 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.09 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  21.13 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  30.29 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  25.63 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  23.29 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  21.7 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.45 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  24.89 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  26.45 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  30.84 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  25.64 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.19 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  23.31 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  30.84 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  24.24 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  22.75 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  23.31 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  23.31 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  22.27 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  22.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.31 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  23.29 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  24.12 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  22.88 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  24.12 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  21.4 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  24.45 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  24.17 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  25.82 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  22.91 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  25.82 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  25.64 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  23.38 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  24.07 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>