More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0586 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  46.94 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  36.84 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  35.89 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  33.46 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  34.63 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.87 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  37.4 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  36.2 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  29.37 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  35.55 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  29.03 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  35.75 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.76 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.64 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.6 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  32.37 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  32.18 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  30.83 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  31.4 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  32.11 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  32.02 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.79 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  32.7 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.76 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  28.22 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  32.7 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.62 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  35.14 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.48 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  33.93 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.96 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  30.28 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  33.96 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.22 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  34.15 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  34.15 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  33.93 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.4 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.56 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.33 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.67 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  33.18 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  31.05 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  32.88 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  31.62 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  30.81 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  35.59 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  32.47 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.63 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  30.88 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  33.65 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  33.02 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  28.5 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  28.98 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  30.47 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  31.62 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  31.06 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  34.42 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.38 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  30.23 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  31.9 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  31.9 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  31.9 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  31.9 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  30.65 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>