94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2627 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 252 aa  477  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  34.48 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  37.93 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  35.07 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  34.6 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.26 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  34.8 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  30.7 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  26.32 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  27.24 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  28.38 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  28.15 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  27.71 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  26.02 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  30.59 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  28.94 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  26.84 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.84 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.03 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  30.92 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  29.19 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  26.21 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  30.2 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  29.51 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  28.94 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  29.66 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  27.47 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  28.57 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  30.05 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  24.07 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  26.98 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  24.9 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  24.42 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  26.61 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  22.71 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  25.73 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  25.73 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  24.58 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  22.86 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  28.86 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  23.67 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.66 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  20.72 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  22.46 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  21.67 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.03 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  30.16 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  26.18 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  25.75 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  23.72 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  23.58 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.51 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  23.95 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  23.21 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  23.27 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  24.4 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  25.79 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0407  type III secretion system inner membrane R protein  26.24 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  25.93 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.26 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1555  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.751445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1765  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1591  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  25.16 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3016  type III secretion apparatus protein EpaR  26.29 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000240675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1591  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.311192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0848  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.29 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.669729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1714  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1734  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3610  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.400398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  25.54 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  23.95 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  21.52 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  23.85 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  24.54 
 
 		 264 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  23.58 
 
 		 261 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1544  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.903592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1843  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0356733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 253 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>