More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0085 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 257 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  82.88 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  73.93 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  74.71 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  71.21 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  53.12 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  52.34 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  40.78 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  46.3 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  42.13 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  38.04 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  42.35 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  41.96 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  35.18 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  39.22 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  39.76 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  37.55 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  36.76 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  36.36 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  36.8 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  35.18 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  38.36 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  37.93 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  37.07 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  41.86 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  35.46 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0165  flagellar biosynthetic protein FliR, putative  38.43 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  35.34 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  37.07 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  42.04 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  35.95 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  37.25 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  32.49 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  34.26 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  35.06 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  37.34 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.86 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  36.91 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0214  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.62 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.45 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  36.44 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  34.24 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  36.05 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  36.8 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  36.29 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  38.11 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  35.18 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  35.27 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0704  flagellar biosynthetic protein FliR  37.66 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0241  flagellar biosynthetic protein FliR  37.66 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0171126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  35.62 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  37.05 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  36.02 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  37.28 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  32.54 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  37.07 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  35.86 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.07 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  33.86 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0624  flagellar biosynthetic protein FliR  37.66 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4646  flagellar biosynthetic protein FliR  36.89 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  0.627037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  37.44 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  37.44 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  31.35 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.35 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.35 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.06 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  34.5 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  32.94 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.84 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1868  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.61 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  37.02 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  37.02 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  32.76 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>