270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2574 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 253 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  49.19 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  46.89 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  48.97 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  47.74 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  46.91 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  50.21 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  45.68 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  43.82 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  40.4 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  43.44 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  41.63 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  43.13 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  42.8 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  42.8 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  36.51 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  43.03 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  33.46 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  33.91 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  33.91 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  31.02 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  29.74 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  31 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  30.58 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.87 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  28.74 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  26.83 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  28.95 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  31.74 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31.78 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  30.92 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  37.2 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  36.41 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  27.56 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.78 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.64 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  27.9 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  28.39 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  31.51 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  35.44 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  34.18 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.8 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.78 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.11 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.16 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  31.69 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.83 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  32.95 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.21 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  29.92 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.62 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  27.62 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  31.09 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  29.79 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  31.02 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  27.95 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  31.78 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  28.75 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  28.28 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.75 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  30.34 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  31.31 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  34.2 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  29.05 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.88 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  29.13 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  31.43 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.6 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  22.81 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>