263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1373 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  77.19 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  71.86 
 
 		 265 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  73 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  73 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  73 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 		 265 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  72.24 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  71.76 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  77.57 
 
 		 265 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  70.94 
 
 		 267 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  75.88 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  68.32 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  50 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  49.23 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  49.23 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  48.08 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  44.92 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  43.19 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  41.95 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  43.97 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  44.53 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  44.49 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  45.23 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  43.83 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  43.98 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  40.85 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  41.1 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  41.28 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  40.17 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  38.71 
 
 		 247 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  40.5 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  40.17 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  40.65 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  41.48 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  40.61 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  39.24 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.4 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  38.87 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  34.91 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  39.15 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  34.48 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.54 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  37.71 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  37.71 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  37.71 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  34.01 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  36.4 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.88 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  34.2 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  35.46 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.88 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  38.36 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  38.07 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  40.57 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  39.74 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  38.14 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  36.99 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  37.71 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  37.08 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  35.84 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  36.86 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  36.94 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.42 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  35.07 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  36.49 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  36.49 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  37.29 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  33.77 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  34.6 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  36.09 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  32.31 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  36.09 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  35.06 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  35.06 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  35.95 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  33.77 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  33.98 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  34.65 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  34.65 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  31.76 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>