223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4185 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
255 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  92.55 
 
 
255 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  86.27 
 
 
239 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  50.79 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  45.96 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  40.32 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  40.17 
 
 
250 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  40.85 
 
 
250 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  38.3 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
250 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 
251 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  38.37 
 
 
256 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 
248 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  38.81 
 
 
248 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  33.06 
 
 
255 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 
256 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  32.62 
 
 
256 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  29.46 
 
 
255 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
256 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  30.56 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  26.25 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  28.4 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  31.46 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  28.78 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.54 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  30.22 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  33.81 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  26.81 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  30.62 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  29.81 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  28.14 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  25.33 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  27.03 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  28.44 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  28.64 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  28.82 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  27.39 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  26.81 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  24.78 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  23.5 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  25.43 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  24.77 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  23.35 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  27.31 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  26.13 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  22.48 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  26.64 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  24.77 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  24.26 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  23.33 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  23.95 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  23.58 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.34 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.59 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  24.64 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  29.08 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  25.85 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.22 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  24.68 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  24.68 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  22.51 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  27.8 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  24.07 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  25.24 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  25.49 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  24.19 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.16 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  25.47 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  23.05 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  22.47 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  23.48 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  27.33 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  23.21 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.31 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  23.48 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  23.48 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  24.6 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  24.54 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  24.05 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  23.45 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0047  type III secretion apparatus protein YscT  29.36 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000121402  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  22.03 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>