205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3589 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  50.41 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  42.56 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  41.32 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  41.32 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  41.98 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  41.63 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  47.08 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  42.91 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  41.49 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  42.55 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  39.13 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  39.13 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  34.78 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  31.33 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  28.37 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  25.88 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  33.18 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  30.45 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  32.26 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32.39 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.99 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  29.86 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  27.8 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.3 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  27.6 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.61 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.26 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  29.38 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  25.64 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  23.67 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.26 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  22.6 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.6 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  26.52 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  28.26 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  26.46 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  31.53 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  26.46 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.22 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.98 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  26.79 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  26.01 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  25.49 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  24.54 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  25.56 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  24.66 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  25.56 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.23 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  24.75 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  29.84 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  25.6 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  26.87 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  22.79 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  23.01 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  23.72 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  23.72 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  23.72 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  26.89 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  24.07 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  26.07 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  27.11 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.88 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  25.89 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  25.93 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  23.73 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  28.05 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  24.36 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.93 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  26.7 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.66 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  27.59 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>