More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0425 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 264 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  73.86 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  55.94 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  51.52 
 
 		 264 aa  294  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  54.17 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  51.17 
 
 		 261 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  50 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  35.92 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.87 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.87 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  35.25 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  32.79 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.6 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  35.16 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  32.47 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  32.13 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  34.53 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  31.67 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  32.08 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  33.06 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  31.1 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  32.32 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.65 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  33.94 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  32.26 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  34.53 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.66 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.09 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  27.71 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  32.19 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.32 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  29.86 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  29.8 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.54 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  29.81 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  30.84 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  28.44 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  33.49 
 
 		 236 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  30.77 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.72 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.49 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.49 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  29.75 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.8 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.82 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.09 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  29.96 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.18 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  30.14 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  26.67 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  29.18 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  27.85 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  30.39 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  27.76 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1408  type III secretion system inner membrane R protein  27.84 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  27.8 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  32.18 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  28.81 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  26.16 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>