232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0284 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  59.84 
 
 		 250 aa  322  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  55.02 
 
 		 250 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  53.41 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  50 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  40.17 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  40.52 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  35.37 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  39.21 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  40.38 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  36.36 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  36.36 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  35.95 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  35.14 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  35.6 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  30.34 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.79 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.73 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  27.35 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  27.16 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  28.33 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.08 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.32 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  27.47 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.64 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  27.42 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  28.8 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  26.61 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  30.84 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  26.02 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  25.93 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  27.47 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  29.52 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  26.38 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  30.37 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  26.55 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.66 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  26.94 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  27.8 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.53 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  21.98 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  25.55 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  27.68 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  24.39 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  24.04 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  25.79 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  28.22 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  27.94 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  24.67 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  25.91 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  23.74 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  25.37 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.03 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  23.79 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  24.69 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  24.69 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  26.55 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  27.71 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  26.16 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  23.65 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  24 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.77 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  25.97 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  27.27 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  25.12 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  27.45 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  25.99 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  24.5 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  25.28 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  25.62 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  23.56 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>