297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1750 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
253 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  42.63 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  42.62 
 
 
255 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
265 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  37.5 
 
 
255 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 
257 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  36.19 
 
 
257 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  32.94 
 
 
259 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  32.93 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 
264 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.06 
 
 
264 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  34.09 
 
 
260 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  38.68 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  31.45 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  36.92 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 
261 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.52 
 
 
255 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 
261 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  30.05 
 
 
255 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  39.27 
 
 
258 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  30.05 
 
 
255 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  28.96 
 
 
255 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  35.55 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  35.98 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.77 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 
258 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  30.29 
 
 
254 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 
259 aa  115  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  29.02 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  34.6 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 
256 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.41 
 
 
264 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  29.54 
 
 
260 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.6 
 
 
261 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  28.34 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  32.53 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.55 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  28.1 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
264 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
264 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
264 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
264 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  37.91 
 
 
252 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  30.88 
 
 
264 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  30.19 
 
 
254 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  30.89 
 
 
264 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
265 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28.86 
 
 
260 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.7 
 
 
240 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  32.91 
 
 
256 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
256 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.15 
 
 
253 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  29.1 
 
 
257 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  30.83 
 
 
253 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
264 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  32.38 
 
 
266 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.23 
 
 
261 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  32.77 
 
 
260 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.71 
 
 
263 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  32.34 
 
 
256 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 
267 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 
265 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.91 
 
 
261 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 
261 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  28.98 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  28.16 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 
265 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.21 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.19 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  27.62 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  32.89 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  28.68 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.79 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  30.88 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  29.96 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  27.07 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>